Атолл Альдабра повністю оточений кораловим рифом, розрізаним трьома проходами; два більш глибоких ділять атол на чотири великі острови, що оточують велику дрібну, зарослу по краях манграми лагуну площею 150 кв.км., яка, в свою чергу, містить кілька острівців. Найбільший з островів - Південний; разом із Західним островом, Середнім островом і Іль Полімнік вони складають близько 186 кв.км. суші.
    Більшість тропічних островів століттями інтенсивно використовувалися людиною, але атол Альдабра вважався негостинним, і моряки за старих часів його обходили; таким чином йому вдалося уникнути безглуздого руйнування, якому піддалися інші відокремлені острівні групи. Його не торкнулися традиційний збір гуано, культивування кокосів або руйнування природного середовища, пов'язане з сучасним туризмом. Але повністю уникнути уваги людини атолу Альдабра не вдалося, і протягом останніх 100 років він був базою заготівельників мангрової деревини, рибалок і ловців черепах. Як завжди, з людиною прийшли домашні тварини, але це вторгнення обмежилося Південним і Західним островами. Уряд Сейшельських островів оголосило весь цей район суворим резерватом; крім того, він є Міжнародної охоронною зоною.
   Як і для всіх ізольованих груп океанічних острів, для Альдабра характерний високий відсоток ендемічних видів. Але ще важливіше, ймовірно, що у світі, де так мало залишилося по-справжньому природного, атол Альдабра дуже близький до цього стану.
   Тут панують два основних типи місцевості. Один зустрічається виключно у східній частині Південного острову: це рідкісний чагарник, дерева з мізерною рослинністю під ними і купи пальм навколо більших прісних озерець. Увесь інший простір зайнято майже непрохідними заростями колючого чагарнику і високої сухої трави.
   Порівняльна близькість Альдабра як до африканського континенту, так і до Мадагаскару дозволила перебратися на ці океанічні острови більшій кількості видів, ніж можна було очікувати. Альдабра володіє дивно багатою флорою, з 273 видами квітучих рослин і папоротей, 19 з яких є ендемічних. Дивно багато представлені тут комахи: зареєстровано понад 1000 видів, у тому числі 127 видів метеликів і метеликів, 36 з яких мешкають тільки тут. Розширюють перелік ендемічні види наземних равликів і ракоподібних, а також сейшельська летюча собака, альдабрская гігантська черепаха та прісноводна риба, що живе виключно в дощовій воді.
   Завдяки його ізольованості атол облюбували для гніздування безліч морських птахів.
Це основне гніздів'я в західному Індійському океані для малого та великого фрегатів, крім того тут мешкають краснохвості і білохвості фаетони, червононогі олуші, білі крачки.
   До найбільш чудових видів птахів Аль-дабри належать, зокрема, альдабрская славка і білозобий пастушок. Альдабрская славка була відкрита в 1968 році, і вважається, що ареал її існування обмежений крихітною ділянкою прибережного скреба. Постежити за нею вдавалося лічені рази, і вона, безумовно, одна з рідкісних птахів у світі. Білозобий пастушок теж ендемічний для Альдабра; це єдиний збережений представник групи нелітаючих птахів, що включала вимерлого дронта.